朱慈烺也不会让这两个监军闲着没事做的，他把监军的职责重新规定了一下，以后负责士兵思想指导，并采办军中物资和发放军饷。
为了防止军官克扣军饷，朱慈烺把军饷统一由监军负责发放，军中人员固定，军饷固定，克扣的现象基本也就杜绝了。
朱慈烺将新营的一万五千名新兵分为四部分，火枪兵、长枪兵、骑兵和炮兵。并派出一千五百名勇卫营的老兵，每人带十个新兵。
原本朱慈烺让人去兵部要一些盔甲武器什么的，兵部表示物资困难，只能从盔甲厂分出三千副盔甲和兵器。
对此朱慈烺也能理解，大明国力每况日下，各地卫所的军户以及官兵甚至连个像样的盔甲都没有，兵部能挤出三千副已经看在他皇太子的面子上了。
在新兵队伍整编完毕之后，朱慈烺立刻下令，全军开始进行训练。
按照朱慈烺的要求，和勇卫营的训练一样，先从队列训练开始，平时带着俯卧撑，负重五公里越野等，等体格训练的差不多的时候，才练习军队格斗术和进行战术训练。
朱慈烺认为，团体作战能力比士兵的单兵作战能力更重要，戚家军的鸳鸯阵就是几人一队，攻守兼备协同作战。大规模作战的时候，以队为单位，无论进攻还是防守，都能如铁桶一般。
这些新兵从流民变成士兵，又训练这么稀奇古怪的东西，最主要的是每天都很累，不少人都觉得吃不消，于是开始耍小聪明，偷懒，磨蹭时间等。
对于这种情况，勇卫营的老兵自然熟门熟路，他们都是过来人，一眼就瞧的明明白白的，二话不说，上去就是一顿棍子。
“还跟老子耍心眼，老子当初就是这么玩的，起来接着练！”
“就你们一个个的，上了战场也是送死的命！”
勇卫营的老兵一边骂着，还一边举着棍子，打了过来。在这种暴力的胁迫下，情况也好转了很多。
看到一个个满不情愿的样子，孙应元直接宣布，凡是每天完不成训练量的，扣掉一钱军饷，并打十军棍，当天就执行。
这个命令宣布后，新兵们立马被治的服服帖帖的，他们每个月的军饷不过二两银子，每天扣一钱的话，一个月后还有军饷嘛。
朱慈烺忽然想到，这些新兵多原本都是淳朴农民，或许可以给他们做做思想工作。于是他安排了一些年纪稍长、思想觉悟高的一些老兵，在训练后休息的时候去和新兵谈天说地，尝试做一些思想工作。
开始讲的都是些大道理，虽然不少人都能听进去，可时间一长也就腻了，还有些油滑的新兵，处于看戏的状态。
所谓魔高一尺，道高一丈，有些老兵混迹行伍几年，都是过来人，当新兵们喊累喊苦时，他们就会告诉新兵们：“一个鞑子的人头值五十两银子，你想不想赚？”
“五十两？！当然想赚了！”很多新兵内心澎湃，鞑子的脑袋真他娘的值钱，要是砍个脑袋的话，就发了呀！
“想赚的话，就他娘的别偷奸耍滑的，练好了本事，上战场赚银子去！”这些老兵趁机煽动道：“我们平时严格督促你们训练是为了你们好，想在战场上活下来，就得靠平时苦练，想要当官发财，就得练好本事多杀鞑子！”
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